生物学・科学に関する雑感。

書籍の紹介が中心です


2010年04月06日

Drosophila santomeaのゲノム

Release of a first draft of the Drosophila santomea genome sequence (v1.0)

http://flybase.org/static_pages/news/articles/2010_01/D_santomea_genome.html

そうこうしているうちに、D. santomeaのゲノムを読んでしまった人たちがいます。Illuminaシークエンサーで54bpの長さを65,900,000本読んで、非常に近い種であるD. yakubaをリファレンスとしてアセンブルしたそうです。de novo アセンブリは今後リリースされる予定だそうです。

modENCODEで読んでいる8種より、santomeaのほうが早かったんですね。Drosophilaでは、13種目のゲノムということになりますか。さらにmauritianaもWashington Univで(454シーケンサー)、albomicansが北京で読まれているようです(詳細不明)。
posted by シロハラクイナ at 02:00| シカゴ ☁| Comment(0) | TrackBack(0) | 日記 | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする
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